vignettes/m01_exercices_module_introduction_a_R.Rmd
m01_exercices_module_introduction_a_R.Rmd
a <- 5
et
b <- 4
a+b
et a*b
.c <- a + 3 * b
ls()
.a
en lui donnant la
valeur 10. Vérifiez votre ré-assignation dans la panneau
Environement.t <- 'texte'
(vous pouvez également utiliser les doubles
quotes comme “texte” mais ne les mélangez pas).a
et t
avec la fonction paste(a, t)
. Que constatez-vous ?paste()
,
pensez à utiliser l’aide de R avec help(paste)
.A <- 15
et
B <- 12
. Que voyez-vous dans la panneau
Environement ?rm()
(utilisez l’aide de R pour avoir plus de
renseignements sur la fonction rm
).Résultat attendu :
#> [1] 5
#> [1] 4
#> [1] 9
#> [1] 20
#> [1] 17
#> [1] "a" "b" "c"
#> [1] 17
#> [1] "texte"
#> [1] "10 texte"
Nous travaillons sur des indicateurs au territoire : “extdata/Base_synth_territoires.csv”, extraits de l’outil GEOIDD du ministère et exportés en csv.
Utiliser la fonction read.csv()
pour importer ce
fichier et le stocker dans un objet df
.
Veillez à ce que la région soit bien importée comme un facteur et non un entier.
Inspecter le dataframe avec les fonctions vues auparavant.
Résultat attendu :
#> 'data.frame': 36689 obs. of 38 variables:
#> $ CODGEO : chr "01001" "01002" "01004" "01005" ...
#> $ LIBGEO : chr "L'Abergement-Clémenciat" "L'Abergement-de-Varey" "Ambérieu-en-Bugey" "Ambérieux-en-Dombes" ...
#> $ REG : Factor w/ 17 levels "01","02","03",..: 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 ...
#> $ DEP : Factor w/ 100 levels "01","02","03",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
#> $ ZAU : Factor w/ 9 levels "111 - Grand pôle (plus de 10 000 emplois)",..: 3 2 2 2 8 2 2 5 8 2 ...
#> $ ZE : Factor w/ 321 levels "0050 - Mont-de-Marsan",..: 260 248 248 260 263 248 248 263 266 250 ...
#> $ P14_POP : int 767 239 14022 1627 109 2570 743 338 1142 397 ...
#> $ P09_POP : int 787 207 13350 1592 120 2328 660 336 960 352 ...
#> $ SUPERF : num 15.95 9.15 24.6 15.92 5.88 ...
#> $ NAIS0914 : int 40 16 1051 117 8 175 59 12 56 25 ...
#> $ DECE0914 : int 25 7 551 41 3 78 20 11 32 10 ...
#> $ P14_MEN : num 306 99.3 6161.1 621.1 52.5 ...
#> $ NAISD15 : int 13 5 222 15 2 21 11 2 18 4 ...
#> $ DECESD15 : int 5 1 121 7 2 9 3 3 5 0 ...
#> $ P14_LOG : num 342.7 161.2 6838.4 661.8 71.5 ...
#> $ P14_RP : num 306 99.3 6161.1 621.1 52.5 ...
#> $ P14_RSECOCC : num 14 47.3 121.6 10.9 10.9 ...
#> $ P14_LOGVAC : num 22.74 14.55 555.64 29.85 8.14 ...
#> $ P14_RP_PROP : num 260 84.6 2769 473.3 37.7 ...
#> $ NBMENFISC13 : int 297 99 6034 617 47 1014 299 140 431 137 ...
#> $ PIMP13 : num NA NA 57.4 NA NA ...
#> $ MED13 : num 22130 23213 19554 22388 21872 ...
#> $ TP6013 : num NA NA 15.1 NA NA ...
#> $ P14_EMPLT : num 85.16 12.81 7452.93 280.57 5.95 ...
#> $ P14_EMPLT_SAL: num 52.19 4.95 6743.37 206.38 3.96 ...
#> $ P09_EMPLT : num 65.57 17.64 7551.68 286.61 5.29 ...
#> $ P14_POP1564 : num 463 141.6 8962.8 1043.1 71.3 ...
#> $ P14_CHOM1564 : num 33 9.84 1059.73 66.33 7.93 ...
#> $ P14_ACT1564 : num 376 121 6681.9 842.1 57.5 ...
#> $ ETTOT14 : int 47 22 1316 141 7 203 66 39 54 36 ...
#> $ ETAZ14 : int 9 1 7 14 0 21 2 5 5 6 ...
#> $ ETBE14 : int 2 3 60 7 0 18 0 2 6 4 ...
#> $ ETFZ14 : int 5 1 131 19 0 21 9 1 13 3 ...
#> $ ETGU14 : int 25 14 892 85 5 114 45 27 24 18 ...
#> $ ETGZ14 : int 6 4 283 19 1 28 16 6 9 7 ...
#> $ ETOQ14 : int 6 3 226 16 2 29 10 4 6 5 ...
#> $ ETTEF114 : int 9 2 385 27 0 38 17 6 9 7 ...
#> $ ETTEFP1014 : int 0 0 109 5 0 15 2 0 3 0 ...
#> CODGEO LIBGEO REG DEP
#> 1 01001 L'Abergement-Clémenciat 84 01
#> 2 01002 L'Abergement-de-Varey 84 01
#> 3 01004 Ambérieu-en-Bugey 84 01
#> 4 01005 Ambérieux-en-Dombes 84 01
#> 5 01006 Ambléon 84 01
#> 6 01007 Ambronay 84 01
#> ZAU ZE
#> 1 120 - Multipolarisée des grandes aires urbaines 8213 - Villefranche-sur-Saône
#> 2 112 - Couronne d'un grand pôle 8201 - Ambérieu-en-Bugey
#> 3 112 - Couronne d'un grand pôle 8201 - Ambérieu-en-Bugey
#> 4 112 - Couronne d'un grand pôle 8213 - Villefranche-sur-Saône
#> 5 300 - Autre commune multipolarisée 8216 - Chambéry
#> 6 112 - Couronne d'un grand pôle 8201 - Ambérieu-en-Bugey
#> P14_POP P09_POP SUPERF NAIS0914 DECE0914 P14_MEN NAISD15 DECESD15
#> 1 767 787 15.95 40 25 306.00000 13 5
#> 2 239 207 9.15 16 7 99.33745 5 1
#> 3 14022 13350 24.60 1051 551 6161.06200 222 121
#> 4 1627 1592 15.92 117 41 621.05374 15 7
#> 5 109 120 5.88 8 3 52.51818 2 2
#> 6 2570 2328 33.55 175 78 1028.00000 21 9
#> P14_LOG P14_RP P14_RSECOCC P14_LOGVAC P14_RP_PROP NBMENFISC13 PIMP13
#> 1 342.73473 306.00000 13.99418 22.740550 260.00000 297 NA
#> 2 161.16023 99.33745 47.27625 14.546538 84.58436 99 NA
#> 3 6838.35437 6161.06200 121.64795 555.644416 2769.00170 6034 57.41294
#> 4 661.76017 621.05374 10.85505 29.851387 473.32736 617 NA
#> 5 71.51818 52.51818 10.85714 8.142857 37.65455 47 NA
#> 6 1160.00000 1028.00000 56.00000 76.000000 779.00000 1014 62.35178
#> MED13 TP6013 P14_EMPLT P14_EMPLT_SAL P09_EMPLT P14_POP1564
#> 1 22130.00 NA 85.157286 52.191539 65.566193 463.00000
#> 2 23213.00 NA 12.814642 4.946329 17.644456 141.62963
#> 3 19554.00 15.11508 7452.926728 6743.374287 7551.682296 8962.84216
#> 4 22387.62 NA 280.569953 206.382233 286.611037 1043.12909
#> 5 21871.67 NA 5.945455 3.963636 5.285714 71.34545
#> 6 21650.67 NA 487.730918 372.758450 491.138876 1614.00000
#> P14_CHOM1564 P14_ACT1564 ETTOT14 ETAZ14 ETBE14 ETFZ14 ETGU14 ETGZ14 ETOQ14
#> 1 33.000000 376.00000 47 9 2 5 25 6 6
#> 2 9.835391 120.97531 22 1 3 1 14 4 3
#> 3 1059.728437 6681.86216 1316 7 60 131 892 283 226
#> 4 66.326127 842.14083 141 14 7 19 85 19 16
#> 5 7.927273 57.47273 7 0 0 0 5 1 2
#> 6 108.000000 1267.00000 203 21 18 21 114 28 29
#> ETTEF114 ETTEFP1014
#> 1 9 0
#> 2 2 0
#> 3 385 109
#> 4 27 5
#> 5 0 0
#> 6 38 15
#> CODGEO LIBGEO REG DEP
#> 36684 97419 Sainte-Rose 04 974
#> 36685 97420 Sainte-Suzanne 04 974
#> 36686 97421 Salazie 04 974
#> 36687 97422 Le Tampon 04 974
#> 36688 97423 Les Trois-Bassins 04 974
#> 36689 97424 Cilaos 04 974
#> ZAU ZE P14_POP
#> 36684 400 - Commune isolée hors influence des pôles 0401 - L'Est 6722
#> 36685 112 - Couronne d'un grand pôle 0402 - Le Nord 22406
#> 36686 400 - Commune isolée hors influence des pôles 0401 - L'Est 7132
#> 36687 111 - Grand pôle (plus de 10 000 emplois) 0404 - Le Sud 76796
#> 36688 112 - Couronne d'un grand pôle 0403 - L'Ouest 7198
#> 36689 400 - Commune isolée hors influence des pôles 0404 - Le Sud 5295
#> P09_POP SUPERF NAIS0914 DECE0914 P14_MEN NAISD15 DECESD15 P14_LOG
#> 36684 6822 177.60 519 186 2322.000 94 43 2542.478
#> 36685 22437 57.84 1963 508 7686.912 358 100 8328.616
#> 36686 7406 103.82 661 235 2420.000 111 46 2987.000
#> 36687 72658 165.43 6663 2004 29662.460 1339 420 32710.091
#> 36688 7057 42.58 531 217 2484.887 104 54 2890.404
#> 36689 5989 84.40 430 186 2016.000 87 38 2732.690
#> P14_RP P14_RSECOCC P14_LOGVAC P14_RP_PROP NBMENFISC13 PIMP13 MED13
#> 36684 2322.000 28.58054 191.8979 1799.954 NA NA NA
#> 36685 7686.912 50.94097 590.7629 4450.648 NA NA NA
#> 36686 2420.000 174.00000 393.0000 1849.000 NA NA NA
#> 36687 29662.460 1004.31703 2043.3140 15372.921 NA NA NA
#> 36688 2484.887 67.58626 337.9313 1773.765 NA NA NA
#> 36689 2016.000 239.56501 477.1253 1522.480 NA NA NA
#> TP6013 P14_EMPLT P14_EMPLT_SAL P09_EMPLT P14_POP1564 P14_CHOM1564
#> 36684 NA 1272.841 920.0617 1269.573 4306.217 1250.516
#> 36685 NA 4296.362 3618.1538 4185.015 14821.042 3712.486
#> 36686 NA 1519.306 1090.0856 1533.305 4650.000 1369.000
#> 36687 NA 16145.620 12486.5465 14807.249 50316.640 12783.137
#> 36688 NA 1273.858 994.3469 1202.079 4850.570 1360.617
#> 36689 NA 1194.383 993.1546 1314.121 3461.457 1122.361
#> P14_ACT1564 ETTOT14 ETAZ14 ETBE14 ETFZ14 ETGU14 ETGZ14 ETOQ14 ETTEF114
#> 36684 2850.155 414 125 44 31 159 59 55 82
#> 36685 10456.196 1323 136 139 190 694 249 164 267
#> 36686 3108.000 490 148 29 43 214 73 56 95
#> 36687 34446.789 5476 565 398 665 3025 999 823 1032
#> 36688 3524.287 456 42 39 61 223 76 91 59
#> 36689 2415.666 360 49 17 35 193 49 66 65
#> ETTEFP1014
#> 36684 8
#> 36685 66
#> 36686 11
#> 36687 204
#> 36688 20
#> 36689 26
#> [1] "CODGEO" "LIBGEO" "REG" "DEP"
#> [5] "ZAU" "ZE" "P14_POP" "P09_POP"
#> [9] "SUPERF" "NAIS0914" "DECE0914" "P14_MEN"
#> [13] "NAISD15" "DECESD15" "P14_LOG" "P14_RP"
#> [17] "P14_RSECOCC" "P14_LOGVAC" "P14_RP_PROP" "NBMENFISC13"
#> [21] "PIMP13" "MED13" "TP6013" "P14_EMPLT"
#> [25] "P14_EMPLT_SAL" "P09_EMPLT" "P14_POP1564" "P14_CHOM1564"
#> [29] "P14_ACT1564" "ETTOT14" "ETAZ14" "ETBE14"
#> [33] "ETFZ14" "ETGU14" "ETGZ14" "ETOQ14"
#> [37] "ETTEF114" "ETTEFP1014"
#> [1] "data.frame"
#> [1] "list"
Nous travaillons toujours sur la même table des indicateurs au territoire, “extdata/Base_synth_territoires.csv”.
A- En utilisant la fonction mutate()
, créer une nouvelle
variable correspondant à la densité de population (rapport de la
population P14_POP
à la superficie de la commune
SUPERF
), ainsi que les taux de natalité et de mortalité (en
pour mille)
B- A l’aide de la fonction select()
, créer une nouvelle
table en ne conservant que le code commune, le type de commune (ZAU), la
région, le département et les variables que vous venez de créer.
C-Enfin, ne conserver les communes correspondant à votre département de naissance et stocker ce dataframe. Attention au type de la variable département !
D- Avec les opérateurs logiques, faire des essais pour sélectionner des échantillons différents.
Résultat attendu :
Nous continuons de travailler sur les indicateurs au territoire
df
avec les variables que nous avons calculées à l’exercice
3.
1- Utilisez la fonction summary()
pour obtenir un résumé
de l’ensemble des variables de la table df
2- Calculez maintenant les moyenne, médiane, écart-type et variance de
la variable de densité de population. Que constatez-vous ?
3- Utilisez le paramètre na.rm = T
pour gérer les valeurs
manquantes
4- Calculez à présent les quartiles puis déciles de cette variable
5- Optionnel : calculez la version centrée réduite de la variable de
densité Rappel
sur la définition de centrer réduire. Avantage des variables
centrées réduites : on élimine les effets d’unité (d’ordre de grandeur),
et on peut donc comparer les distributions de deux variables qui ont des
unités différentes (voir module 3).
6- Tableaux croisés :
Résultat attendu :
#> CODGEO LIBGEO REG DEP
#> Length:36689 Length:36689 44 : 5198 62 : 895
#> Class :character Class :character 76 : 4565 02 : 816
#> Mode :character Mode :character 75 : 4505 80 : 782
#> 84 : 4189 76 : 745
#> 32 : 3838 57 : 730
#> 27 : 3831 14 : 707
#> (Other):10563 (Other):32014
#> ZAU
#> 112 - Couronne d'un grand pôle :12297
#> 400 - Commune isolée hors influence des pôles : 7383
#> 300 - Autre commune multipolarisée : 7021
#> 120 - Multipolarisée des grandes aires urbaines: 3962
#> 111 - Grand pôle (plus de 10 000 emplois) : 3285
#> 221 - Petit pôle (de 1 500 à 5 000 emplois) : 888
#> (Other) : 1853
#> ZE P14_POP P09_POP
#> 0061 - Toulouse : 717 Min. : 0 Min. : 0
#> 2307 - Rouen : 501 1st Qu.: 197 1st Qu.: 193
#> 2210 - Amiens : 479 Median : 444 Median : 431
#> 7310 - Tarbes - Lourdes: 455 Mean : 1838 Mean : 1793
#> 2102 - Troyes : 452 3rd Qu.: 1110 3rd Qu.: 1072
#> 2603 - Dijon : 448 Max. :2220445 Max. :2234105
#> (Other) :33637 NA's :821 NA's :821
#> SUPERF NAIS0914 DECE0914 P14_MEN
#> Min. : 0.04 Min. : 0.0 Min. : 0.00 Min. : 0.0
#> 1st Qu.: 6.44 1st Qu.: 9.0 1st Qu.: 8.00 1st Qu.: 83.8
#> Median : 10.81 Median : 23.0 Median : 17.00 Median : 183.2
#> Mean : 17.64 Mean : 114.4 Mean : 77.35 Mean : 802.0
#> 3rd Qu.: 18.58 3rd Qu.: 60.0 3rd Qu.: 43.00 3rd Qu.: 454.9
#> Max. :18360.00 Max. :150843.0 Max. :69907.00 Max. :1147990.9
#> NA's :821 NA's :821 NA's :821 NA's :821
#> NAISD15 DECESD15 P14_LOG P14_RP
#> Min. : 0.00 Min. : 0.00 Min. : 0.0 Min. : 0.0
#> 1st Qu.: 1.00 1st Qu.: 1.00 1st Qu.: 115.0 1st Qu.: 83.8
#> Median : 4.00 Median : 3.00 Median : 239.1 Median : 183.2
#> Mean : 21.96 Mean : 16.47 Mean : 970.2 Mean : 802.0
#> 3rd Qu.: 11.00 3rd Qu.: 9.00 3rd Qu.: 565.0 3rd Qu.: 454.9
#> Max. :28267.00 Max. :13997.00 Max. :1362181.9 Max. :1147990.9
#> NA's :821 NA's :821 NA's :821 NA's :821
#> P14_RSECOCC P14_LOGVAC P14_RP_PROP NBMENFISC13
#> Min. : 0.00 Min. : 0.00 Min. : 0.0 Min. : 32.0
#> 1st Qu.: 7.00 1st Qu.: 8.00 1st Qu.: 68.4 1st Qu.: 102.0
#> Median : 19.00 Median : 18.00 Median : 148.0 Median : 205.0
#> Mean : 91.63 Mean : 76.60 Mean : 462.2 Mean : 809.7
#> 3rd Qu.: 49.29 3rd Qu.: 43.75 3rd Qu.: 349.2 3rd Qu.: 484.0
#> Max. :107061.99 Max. :107129.02 Max. :381934.3 Max. :1038789.0
#> NA's :821 NA's :821 NA's :821 NA's :3793
#> PIMP13 MED13 TP6013 P14_EMPLT
#> Min. :24.46 Min. :10021 Min. : 5.00 Min. : 0.0
#> 1st Qu.:50.57 1st Qu.:18452 1st Qu.: 8.73 1st Qu.: 26.0
#> Median :58.40 Median :19844 Median :11.97 Median : 66.8
#> Mean :58.98 Mean :20250 Mean :13.35 Mean : 733.9
#> 3rd Qu.:67.19 3rd Qu.:21563 3rd Qu.:16.80 3rd Qu.: 229.5
#> Max. :89.38 Max. :46251 Max. :44.84 Max. :1801865.8
#> NA's :31598 NA's :3793 NA's :32531 NA's :821
#> P14_EMPLT_SAL P09_EMPLT P14_POP1564
#> Min. : 0.0 Min. : 0.0 Min. : 0.0
#> 1st Qu.: 13.0 1st Qu.: 26.1 1st Qu.: 120.3
#> Median : 42.0 Median : 65.2 Median : 275.0
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#> 3rd Qu.: 173.4 3rd Qu.: 220.6 3rd Qu.: 684.8
#> Max. :1562078.5 Max. :1805470.4 Max. :1554076.1
#> NA's :821 NA's :9 NA's :821
#> P14_CHOM1564 P14_ACT1564 ETTOT14 ETAZ14
#> Min. : 0.00 Min. : 0.0 Min. : 0.0 Min. : 0.00
#> 1st Qu.: 8.85 1st Qu.: 90.5 1st Qu.: 19.0 1st Qu.: 4.00
#> Median : 20.45 Median : 208.3 Median : 38.0 Median : 7.00
#> Mean : 119.75 Mean : 855.8 Mean : 179.3 Mean : 11.36
#> 3rd Qu.: 51.78 3rd Qu.: 518.0 3rd Qu.: 92.0 3rd Qu.: 14.00
#> Max. :144515.41 Max. :1202565.3 Max. :551952.0 Max. :587.00
#> NA's :821 NA's :821 NA's :25 NA's :25
#> ETBE14 ETFZ14 ETGU14 ETGZ14
#> Min. : 0.000 Min. : 0.00 Min. : 0.0 Min. : 0.00
#> 1st Qu.: 1.000 1st Qu.: 2.00 1st Qu.: 7.0 1st Qu.: 1.00
#> Median : 3.000 Median : 5.00 Median : 17.0 Median : 4.00
#> Mean : 9.417 Mean : 18.18 Mean : 116.1 Mean : 28.73
#> 3rd Qu.: 7.000 3rd Qu.: 12.00 3rd Qu.: 47.0 3rd Qu.: 13.00
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#> NA's :25 NA's :25 NA's :25 NA's :25
#> ETOQ14 ETTEF114 ETTEFP1014 densite
#> Min. : 0.00 Min. : 0.00 Min. : 0.00 Min. : 0.00
#> 1st Qu.: 2.00 1st Qu.: 4.00 1st Qu.: 0.00 1st Qu.: 18.59
#> Median : 4.00 Median : 8.00 Median : 1.00 Median : 40.35
#> Mean : 24.22 Mean : 41.33 Mean : 10.28 Mean : 160.15
#> 3rd Qu.: 10.00 3rd Qu.: 19.00 3rd Qu.: 4.00 3rd Qu.: 94.57
#> Max. :48893.00 Max. :124131.00 Max. :24527.00 Max. :27126.14
#> NA's :25 NA's :25 NA's :25 NA's :821
#> tx_natal tx_mort
#> Min. : 0.000 Min. : 0.000
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#> 3rd Qu.: 12.931 3rd Qu.: 12.389
#> Max. :111.111 Max. :157.738
#> NA's :827 NA's :827
#> [1] NA
#> [1] NA
#> [1] NA
#> [1] NA
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#> [1] 0.0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 1.0
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#> 0.00000 10.03439 15.65357 21.84208 29.76144 40.35457
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#> 54.82089 77.65199 119.08740 240.40789 27126.14108
#> ZAU
#> 111 - Grand pôle (plus de 10 000 emplois)
#> 3285
#> 112 - Couronne d'un grand pôle
#> 12297
#> 120 - Multipolarisée des grandes aires urbaines
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#> 211 - Moyen pôle (5 000 à 10 000 emplois)
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#> 300 - Autre commune multipolarisée
#> 7021
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#> ZAU
#> 111 - Grand pôle (plus de 10 000 emplois)
#> 8.95
#> 112 - Couronne d'un grand pôle
#> 33.52
#> 120 - Multipolarisée des grandes aires urbaines
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#> 211 - Moyen pôle (5 000 à 10 000 emplois)
#> 1.24
#> 212 - Couronne d'un moyen pôle
#> 2.22
#> 221 - Petit pôle (de 1 500 à 5 000 emplois)
#> 2.42
#> 222 - Couronne d'un petit pôle
#> 1.59
#> 300 - Autre commune multipolarisée
#> 19.14
#> 400 - Commune isolée hors influence des pôles
#> 20.12
#> ZAU
#> REG 111 - Grand pôle (plus de 10 000 emplois) 112 - Couronne d'un grand pôle
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#> ZAU
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#> ZAU
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#> ZAU
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#> ZAU
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#> 93 0.73
#> 94 0.41
Nous travaillons toujours sur le dataset df
calculé à
l’exercice précédent.
À l’aide de l’aide mémoire ggplot2 :
fill
de la fonction
aes()
pour améliorer le graphiqueaes()
)Résultat attendu :